A AMDEC surgiu de uma iniciativa de uma equipa de colaboradores de uma organização não-governamental francesa, ESSOR, de criar uma organização nacional que desse continuidade às actividades implementadas pela ESSOR no país. Com o apoio desta, a AMDEC passou a assumir os projectos em curso em 2003 e em 2004 iniciou o processo da sua legalização. A actual Directora Executiva participou em todo este processo.

O foco da sua actividade em 2004 era o fortalecimento das organizações comunitárias de base. Passou por diferentes fases no seu processo de consolidação e, em 2006 iniciou a implementação de um projecto na Cidade de Maputo, como sub-contratada da ESSOR.

Em 2007 começa a implementar projectos directamente, para além dos que fazia em parceria com a ESSOR. Um dos seus projectos de referência foi o de saneamento e drenagem num dos bairros da Cidade de Maputo e iniciou também a colaboração com o Ministério da Mulher, Criança e Acção Social, através da Direcção que superintende a área da acção social e educação da primeira Infância, o Conselho Municipal da Cidade de Maputo, Conselho Nacional de Combate ao HIV/SIDA (CNCS).

Tem mantido parcerias com diferentes organizações e parceiros o que permitiu continuar as suas actividades até hoje. Neste processo expandiu as suas intervenções para as províncias de Gaza, Inhambane e Sofala.